报告题目：3D genome regulation in development and diseases
报 告 人：李 程 教 授
报告时间：2024年12月4日（星期三），上午9:30
报告地点：生科院1号楼109会议室
主办单位：生命科学学院、江苏省比较基因组学重点实验室、江苏省基因组学国际联合研究中心、科学技术研究院
报告人简介：
李程教授/博士生导师，国家杰出青年科学基金获得者，任职于北京大学生命科学学院，北京大学统计科学中心及北京大学生物信息中心。1995年本科毕业于北京师范大学数学系，2001年博士毕业于美国加州大学洛杉矶分校统计系。2002至2013年在哈佛大学生物统计系暨Dana-Farber 癌症研究所先后担任助理教授和副教授。2013年起在北京大学任职。现担任中国遗传学会三维基因组学专委会、中国生物信息学基因组信息学专委会副主任委员。实验室使用和发展组学新技术，以研究大脑衰老和再生过程的机制和干预方法。采用高通量实验技术和计算方法相结合的手段，系统开展了细胞命运调控的三维基因组与多组学研究。发现了加速干细胞重编程和治疗难治性肿瘤的新靶点，为三维基因组学发展了新技术，为染色质高级结构参与细胞命运调控研究开拓了新视角。研究组开发的dChip（生物芯片分析）、ComBat（批次效应矫正）等基因组数据分析算法和软件被同行广泛使用，发表学术论文150余篇，包括作为通讯作者发表在Cell、Cell Stem Cell、Cancer Cell、Nature Immunology的论文，谷歌学术累计引用48,000次，h-index为79。研究组获得国家自然科学基金委员会杰出青年科学基金项目、基础科学中心项目、科技部重点研发计划的资助。研究组介绍网页：http://3d-genome.life/。
报告摘要：
三维基因组学是一个新兴的表观遗传学研究方向，其研究重点在于理解基因组的空间组织结构以及这种结构如何影响基因表达和调控。在真核生物中，基因组不是以线性形式存在，而是以复杂的三维空间结构呈现。这种三维结构主要由染色质纤维通过各种相互作用形成，包括染色质环、拓扑结构域、AB区室、染色质互作枢纽等。在本报告中，将首先介绍基于高通量测序的方法，如Hi-C，这些方法能够提供高分辨率数据，在全基因组范围揭示染色质空间互作网络和动态。染色质互作的异常变化与多种疾病相关，如癌症、神经退行性疾病等。因此，研究染色质互作的机制和功能，有助于我们理解疾病的发病机制，并开发出新的治疗方法。
