“比较基因组学省高校重点实验室”于2016年12月由江苏省教育厅批准立项建设，2024年1月完成优化重组。实验室聚焦前沿基础研究与转化应用融合发展，积极开展比较基因组学研究领域的探索与创新，凝练形成三个主要研究方向：基因组大数据分析方法与技术、动植物遗传资源挖掘与种质创新、人类遗传资源与生命健康。实验室秉承“求实创新，协同育人”的理念，充分发挥在基因组大数据分析方法与技术方面的优势，在基础研究、人才培养、技术转化和国际交流等方面不断开拓进取，提升国际国内学术影响力。
实验室在基因组数据分析领域与哈佛大学、佐治亚大学、新加坡国立大学和复旦大学等国内外一流高校建立了密切的合作关系，并取得了一系列突破性成果。先后承担包括国家自然科学基金重点国际（地区）合作项目、国家重点研发计划青年科学家项目在内的国家级课题，相关成果发表在《PNAS》《National Science Review》《Nature Communications》等国际一流学术期刊。
